Virus [Bio, biotech,…] (immunité, vaccins, coronavirus, covid-19, etc.)

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Message par siamois93 le Mar 19 Mai 2020 - 4:29

Un traitement en cours de développement :

http://www.bonusbiogroup.com/index.php/news-media/press-releases/item/32-bonus-biogroup-has-initiated-a-preclinical-study-of-a-unique-drug-developed-for-the-treatment-of-life-threatening-respiratory-distress-in-corona-covid-19-patients-and-pneumonia

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Message par zebu40 le Mar 19 Mai 2020 - 9:33

siamois93 a écrit:Un traitement en cours de développement :

http://www.bonusbiogroup.com/index.php/news-media/press-releases/item/32-bonus-biogroup-has-initiated-a-preclinical-study-of-a-unique-drug-developed-for-the-treatment-of-life-threatening-respiratory-distress-in-corona-covid-19-patients-and-pneumonia
merci pour cette petite lueur pour les malades qui auront le malheur de développer ces symptomes

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Message par doom le Ven 21 Aoû 2020 - 11:39

"Robust T cell immunity in convalescent individuals with asymptomatic or mild COVID-19"

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31008-4?rss=yes
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Message par 404 le Jeu 10 Déc 2020 - 10:05

Déterrage de topic avec le premier papier (à ma connaissance) de résultats de phase 3 sur un vaccin covid (ni pfizer, ni moderna du coup):

https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)32661-1/fulltext
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Message par Mentounasc le Jeu 10 Déc 2020 - 13:50

Merci à 404 pour le lien.

Je me suis tapé la lecture du document concerné, et j'ai surtout retenu une chose intéressante : l'efficacité est plus grande en primovaccination avec faible dose (efficacité supérieure à 90%) qu'en double vaccination avec 2 doses "standart" (efficacité de l'ordre de 60%).

Peut-on en déduire quelque chose d'intéressant ?

La question a une importance vitale, notamment sur le plan politique.
Parce que pour les défenseurs du principe de l'immunité d'ensemble (c'est à dire ne pas vacciner la population et laisser la contamination se répandre pour qu'une immunité finisse par s'installer), il pourrait être tentant de penser alors qu'une faible exposition au virus peut suffire à provoquer l'immunité.
Oui mais voilà : dans un vaccin "traditionnel", les virus sont très nettement atténués, voire dénués de leur contagiosité. Et dans les nouveaux vaccins obtenus par manipulation génétique, on a une caractéristique équivalente.
Donc comparer "une faible exposition au virus" à une vaccination est une hérésie scientifique, ce qui tend à montrer que la politique suivie par certains pays (Suède notamment) est loin d'être viable sur le plan de la virologie. Et, de toutes façons, la façon de vivre des suédois et le fonctionnement de cette société est compatible avec leurs habitudes de vie et leur climat, et ne serait pas applicable chez nous. Il n'y a d'ailleurs qu'à voir la catastrophe brésilienne pour s'en convaincre.
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Message par 404 le Jeu 10 Déc 2020 - 14:49

Ce vaccin ci est un vaccin "traditionnel" comme tu dis (je suppose que "traditionnel" en à mettre en opposition à "vaccin à ARN"; et ce n'est pas "une seule technique", il y en a plusieurs). Et apparemment l'hypothèse faite c'est que la plus faible dose lors de la première injection permet une réaction du système immunitaire plus forte lors de la seconde injection, et ils ont lancé un essai spécifique pour regarder plus près cet effet.
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Message par Palika le Ven 11 Déc 2020 - 20:51

Mentounasc a écrit:La question a une importance vitale, notamment sur le plan politique.
Parce que pour les défenseurs du principe de l'immunité d'ensemble (c'est à dire ne pas vacciner la population et laisser la contamination se répandre pour qu'une immunité finisse par s'installer), il pourrait être tentant de penser alors qu'une faible exposition au virus peut suffire à provoquer l'immunité.
Oui mais voilà : dans un vaccin "traditionnel", les virus sont très nettement atténués, voire dénués de leur contagiosité. Et dans les nouveaux vaccins obtenus par manipulation génétique, on a une caractéristique équivalente.
Donc comparer "une faible exposition au virus" à une vaccination est une hérésie scientifique, ce qui tend à montrer que la politique suivie par certains pays (Suède notamment) est loin d'être viable sur le plan de la virologie.
L'idée qu'une faible exposition au virus développerait l'immunité reste très spéculative (en tout cas, insuffisamment solide pour fonder des politiques dessus) mais n'est pas spécialement "une hérésie scientifique". Elle a notamment été avancée dans cet article: https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp2026913
Mentounasc a écrit: Et, de toutes façons, la façon de vivre des suédois et le fonctionnement de cette société est compatible avec leurs habitudes de vie et leur climat, et ne serait pas applicable chez nous. Il n'y a d'ailleurs qu'à voir la catastrophe brésilienne pour s'en convaincre.
Indépendamment de ce qu'on pense de la stratégie suivie par la Suède et de ses résultats (en toute franchise: mauvais, mais pas spécialement pires qu'en France) j'ai peine à comprendre en quoi les habitudes de vie et le climat de la France se rapprocheraient davantage de ceux du Brésil...
Sur la question du vaccin, 404 a déjà répondu, mais le résultat paraît assez bizarre, en effet.

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Message par Topsy Turvy le Mar 15 Déc 2020 - 12:16

Quelques dates de l'histoire des vaccins depuis Jenner en 1796 :

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/publication/33064991
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Message par Topsy Turvy le Mar 15 Déc 2020 - 12:22

Du même numéro de Cell, un article qui relate l'histoire des vaccins (en anglais) :
https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.09.040
Why and How Vaccines Work
Iwasaki, Akiko et al.
Cell, Volume 183, Issue 2, 290 - 295

Vaccines save millions of lives from infectious diseases caused by viruses and bacteria. As the world awaits safe and effective COVID-19 vaccines, we celebrate the progresses made and highlight challenges ahead in vaccines and the science behind them.
[...]
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Message par 404 le Mer 16 Déc 2020 - 13:15

Papier des résultats de phase 3 du vaccin Pfizer

https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2034577
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Message par Topsy Turvy le Lun 28 Déc 2020 - 9:52

Topsy Turvy a écrit:Hello, welcome,

Je vous propose ici de (re)voir quelques notions de sciences et technologie du vivant en rapport avec le(s) (corona)virus.
On va commencer par diverses vidéos que je trouve sympas et de qualité, tant en terme de contenu que de présentation.
Le niveau d’explication et le style de présentation couverts sont variés, du niveau élémentaire fun au niveau avancé pointu.

J’ai sélectionné des vidéo YT uniquement pour pouvoir les intégrer directement dans les messages.
Malheureusement, beaucoup des vidéos qui me paraissent les plus intéressantes sont en anglais
Mais les vidéos en anglais proposées ici proposent des sous-titres (ou le script annexé, au pire).

Vous pouvez choisir le français comme langue de sortie des sous-titres.
Pour être sûr d’en bénéficier, sélectionner en bas à droite de l’image : Sous-titres,
puis : Paramètres - Sous-titres anglais-blabla - Traduire automatiquement - Français.

Merci de respecter la vocation informative que je souhaiterais pour ce fil :
- en respectant les autres même s’ils en savent moins ou plus que vous ;
- en évitant de confondre ici les savoirs académiques des autres savoirs ;
- en évitant de dévier trop loin des sciences du vivant au sens large.

Je propose à la louche un label S, M, L et En, Fr selon le niveau d’explication et la langue.
Sorry pour le flood initial, je trouve plus clair de découper en messages pas trop chargés.
N’hésitez pas à alimenter le fil, poser des questions, proposer du contenu et des réponses.

Enjoy !

Ça faisait longtemps que je n'avais plus proposé de petites vidéos didactiques ici...

[M - En] Vaccins à ARNm contre COVID-19 et rôle critique des nanoparticules lipidiques (4'49)

Résumé
Le monde a un besoin urgent d'un vaccin COVID-19, mais les méthodes traditionnelles de développement d'un vaccin prennent de nombreuses années. Les vaccins à ARN (vaccins à ARNm) représentent une nouvelle approche passionnante pour découvrir rapidement des vaccins. Cependant, le principal défi avec les vaccins à ARN est de savoir comment fournir de l'ARN à l'intérieur des cellules immunitaires. La nanotechnologie à la rescousse! Les nanoparticules lipidiques sont un composant essentiel des vaccins à ARN. Cette vidéo nous explique le rôle des nanoparticules lipidiques dans la délivrance d'ARN et comment cette nouvelle technologie pourrait sauver la situation.
Références
Matthew D. Shin et coll. Nature Nanotechnology, Vol 15, 2020, 646-655.
Andreas M. Reichmuth et coll. Therapeutic Delivery, Vol 7, 2016, 319-334.

COVID-19 RNA vaccines and the critical role of lipid nanoparticles (4'49)

ScienceSketch


Dernière édition par Topsy Turvy le Lun 28 Déc 2020 - 10:00, édité 1 fois
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Message par Topsy Turvy le Lun 28 Déc 2020 - 9:59

[M - Fr] COVID-19 : comment fonctionnent les vaccins entiers, à ARN ? Quelle efficacité ? Effets secondaires? (10'44)

Résumé
Présentation des publications (essais de phase I, II et III) et principes des vaccins
00:30 Principe de la vaccination
01:40 Les vaccins à virus entier (inactivé, atténué). Ex : CoronaVac, Sinopharm
02:42 Vaccins à sous-unités du virus. Ex : Novavax
03:04 Vaccins à ADN, à ARNm
03:45 De l'ADN aux protéines : l'expression génétique
07:09 Vaccins à vecteurs viraux
08:35 Synthèse des résultats des essais de Phase III pour les vaccins contre la COVID-19

[M - Fr] COVID-19 : comment fonctionnent les vaccins entiers, à ARN ? Quelle efficacité ? Effets secondaires? (10'44)

Thibault Fiolet - Quoidansmonassiette
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Message par 404 le Mer 6 Jan 2021 - 11:40

Parce que des fois les billets de blog c'est bien aussi. Ou comment traiter de la question de "comment vulgariser la question du risque d'intégration au génome d'ARN messager d'un vaccin".

https://tanialouis.fr/2020/12/27/le-compromis-de-la-vulgarisation/

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Message par Topsy Turvy le Mer 6 Jan 2021 - 12:14

Ah, oui, ça change... merci.
Je propose de retenir sa proposition finale (en gros) :
Comment faire mieux

Il arrive un peu tard par rapport à ma micro-interview du 12 décembre mais, après plusieurs semaines de silence volontaire sur ce sujet, voici le résultat de ma réflexion : la question « les vaccins à ARN messagers peuvent-ils modifier notre ADN ? » est mal posée, il faut donc s’autoriser à botter en touche pour répondre à une autre question, plus pertinente.

Note : je n’ai jamais dit que ma solution était révolutionnaire et brillante. Elle est ridiculement simple et, d’après ce que j’ai lu ces derniers temps, je suis loin d’être la seule à être arrivée à cette conclusion.
[...]
Ça tombe bien, la question qu’il faut traiter ensuite n’est pas « comment ces ARN messagers pourraient-ils modifier notre ADN ? », « est-ce qu’on peut l’éviter ? » ou « est-ce que cette modification de l’ADN est susceptible d’être grave ? ».

Le cœur du sujet est la balance bénéfice/risque de ces vaccins, contre un virus qui circule très efficacement dans la population et que tout le monde risque donc d’attraper. La seule question qui vaille est : « est-ce que ce risque de modification de l’ADN est plus important avec le vaccin qu’avec le virus ? ».

Et hop, il devient facile d’y répondre sans entrer dans des explications compliquées.

Le vaccin consiste à injecter un ARN messager, dans une zone du corps, et une fois ces molécules détruites le stock n’est pas renouvelé. L’infection par le virus aboutit à la production de plusieurs ARN messagers différents, simultanément dans différents organes, et le stock d’ARN est renouvelé en continu par les cellules infectées. Quelle que soit la probabilité qu’un ARN messager modifie l’ADN de la cellule dans laquelle il se trouve, ce risque est beaucoup plus élevé pour les ARN messagers viraux produits en cas d’infection que pour l’ARN messager injecté pour la vaccination. Ce n’est donc pas une raison de préférer le risque d’infection à la vaccination.

Ça ne tient toujours pas en neuf secondes de JT, mais ça tient en moins de cinq tweets. [...]
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Message par Topsy Turvy le Mer 13 Jan 2021 - 20:23

L'histoire des vaccins mais axée sur les innovations utilisées et les perspectives :

Vaccinology in the post−COVID-19 era
Rino Rappuoli, Ennio De Gregorio, Giuseppe Del Giudice, Sanjay Phogat, Simone Pecetta, Mariagrazia Pizza, Emmanuel Hanon
Proceedings of the National Academy of Sciences
Jan 2021, 118 (3)
Perspective
https://doi.org/10.1073/pnas.2020368118

Virus [Bio, biotech,…] (immunité, vaccins, coronavirus, covid-19, etc.) - Page 3 Tmpf110
Figure 1
Technological advances that merged to develop a COVID-19 vaccine.


Virus [Bio, biotech,…] (immunité, vaccins, coronavirus, covid-19, etc.) - Page 3 Tmpf310
Figure 3
Vaccines developed addressing naïve, previously exposed, and chronic infections. Green (A) are vaccines available or doable with existing technologies. Bold, available vaccines. Yellow (B) and orange (C) are doable vaccines with increasing challenges for today’s technologies. Red (D) are targets for which we do not yet have the scientific knowledge and technologies. HAV, hepatitis A virus; HBV, hepatitis B virus; HPV, human papillomavirus; TB, tuberculosis; RSV, respiratory syncytial virus; AMR, antimicrobial resistance; E. coli, Escherichia coli; Staph, Staphylococcus aureus; C. difficile, Clostridium difficile; GBS, group B Streptococcus; HSV1, herpes simplex virus 1; HSV2, herpes simplex virus 2; HHV, 6-7 human herpes viruses 6 and 7; CMV, cytomegalovirus; EBV, Epstein-Barr virus; HIV, human immunodeficiency virus; HCV, hepatitis C virus.
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Message par Topsy Turvy le Mer 13 Jan 2021 - 20:46

Une revue de neuf vaccins (de EU, US, Russie, Chine et Australie) :

Current State of the First COVID-19 Vaccines
by Birgit M. Prüβ
Vaccines 2021, 9(1), 30;
https://doi.org/10.3390/vaccines9010030

A quick search on 26 November 2020 on ClinicalTrials.gov (https://clinicaltrials.gov), using COVID vaccine as search term yielded 141 studies. Of these, 43 were phase III trials. This chapter details information about nine SARS CoV-2 vaccines that were developed in the EU, US, Russia, China, and Australia and were in phase III trials on 8 November 2020.
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Message par Topsy Turvy Hier à 12:15

Elle écrit bien, mais beaucoup, comme d'hab' :
https://www.bbc.com/future/article/20210114-covid-19-how-effective-is-a-single-vaccine-dose
How effective is a single vaccine dose against Covid-19?
By Zaria Gorvett [encore elle]
15th January 2021
Pretend it didn't happen – expert advice on how to behave after receiving a single dose of any of the Covid-19 vaccines.
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